Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms