Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1P11387 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1P11387 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1P11387 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1P11387 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1P11387 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1P11387 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1P11387 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1P11387 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1P11387 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1P11387 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1P11387 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1P11387 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1P11387 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1P11387 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1P11387 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1P11387 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1P11387 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1P11387 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1P11387 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1P11387 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1P11387 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1P11387 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1P11387 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1P11387 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1P11387 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1P11387 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1P11387 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1P11387 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1P11387 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP1P11387 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP1P11387 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP1P11387 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1P11387 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1P11387 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1P11387 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1P11387 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1P11387 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1P11387 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1P11387 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1P11387 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1P11387 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1P11387 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1P11387 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms