Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB1P11230 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms