Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms