Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RARBP10826 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARBP10826 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARBP10826 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARBP10826 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARBP10826 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARBP10826 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARBP10826 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARBP10826 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARBP10826 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARBP10826 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARBP10826 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARBP10826 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARBP10826 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARBP10826 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RARBP10826 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RARBP10826 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RARBP10826 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RARBP10826 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RARBP10826 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARBP10826 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARBP10826 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARBP10826 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARBP10826 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARBP10826 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARBP10826 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARBP10826 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARBP10826 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARBP10826 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARBP10826 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARBP10826 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARBP10826 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARBP10826 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARBP10826 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARBP10826 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARBP10826 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARBP10826 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARBP10826 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARBP10826 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARBP10826 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARBP10826 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARBP10826 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARBP10826 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARBP10826 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARBP10826 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARBP10826 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARBP10826 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARBP10826 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARBP10826 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARBP10826 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARBP10826 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARBP10826 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARBP10826 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RARBP10826 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RARBP10826 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARBP10826 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARBP10826 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARBP10826 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARBP10826 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms