Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAA1P0DJI8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms