Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR29P0C7W0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms