Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PKHD1P08F94 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PKHD1P08F94 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PKHD1P08F94 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PKHD1P08F94 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PKHD1P08F94 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PKHD1P08F94 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PKHD1P08F94 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PKHD1P08F94 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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PKHD1P08F94 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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