Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HSP90AB1P08238 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB1P08238 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms