Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM3P06753 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM3P06753 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM3P06753 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM3P06753 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM3P06753 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM3P06753 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM3P06753 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM3P06753 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM3P06753 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM3P06753 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM3P06753 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM3P06753 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM3P06753 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM3P06753 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM3P06753 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM3P06753 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM3P06753 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM3P06753 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM3P06753 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM3P06753 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM3P06753 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM3P06753 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM3P06753 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM3P06753 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM3P06753 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM3P06753 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM3P06753 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM3P06753 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM3P06753 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TPM3P06753 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM3P06753 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM3P06753 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM3P06753 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM3P06753 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM3P06753 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM3P06753 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM3P06753 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM3P06753 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM3P06753 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM3P06753 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM3P06753 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms