Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC3P02656 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC3P02656 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC3P02656 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC3P02656 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC3P02656 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC3P02656 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC3P02656 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC3P02656 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC3P02656 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC3P02656 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC3P02656 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC3P02656 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC3P02656 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC3P02656 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC3P02656 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC3P02656 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC3P02656 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC3P02656 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC3P02656 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC3P02656 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC3P02656 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC3P02656 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC3P02656 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC3P02656 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC3P02656 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC3P02656 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC3P02656 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC3P02656 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms