Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
COL2A1P02458 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL2A1P02458 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms