Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms