Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLOT1O75955 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLOT1O75955 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms