Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RPS6KA4O75676 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA4O75676 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms