Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITX3O75364 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITX3O75364 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITX3O75364 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITX3O75364 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITX3O75364 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX3O75364 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX3O75364 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms