Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms