Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX16O60231 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX16O60231 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX16O60231 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX16O60231 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX16O60231 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX16O60231 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX16O60231 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX16O60231 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX16O60231 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX16O60231 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX16O60231 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX16O60231 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX16O60231 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX16O60231 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX16O60231 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX16O60231 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX16O60231 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX16O60231 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX16O60231 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX16O60231 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX16O60231 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
DHX16O60231 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
DHX16O60231 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX16O60231 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX16O60231 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX16O60231 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX16O60231 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX16O60231 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms