Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBFA2T2O43439 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms