Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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HOXA2O43364 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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HOXA2O43364 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA2O43364 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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