Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTSS1O43312 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms