Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPATO15228 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPATO15228 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPATO15228 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPATO15228 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPATO15228 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPATO15228 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPATO15228 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPATO15228 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNPATO15228 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNPATO15228 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNPATO15228 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNPATO15228 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNPATO15228 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNPATO15228 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNPATO15228 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNPATO15228 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNPATO15228 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNPATO15228 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNPATO15228 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNPATO15228 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPATO15228 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNPATO15228 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNPATO15228 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNPATO15228 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNPATO15228 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GNPATO15228 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNPATO15228 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNPATO15228 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNPATO15228 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GNPATO15228 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNPATO15228 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNPATO15228 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GNPATO15228 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNPATO15228 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNPATO15228 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNPATO15228 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNPATO15228 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNPATO15228 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNPATO15228 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNPATO15228 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNPATO15228 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNPATO15228 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNPATO15228 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNPATO15228 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNPATO15228 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNPATO15228 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNPATO15228 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNPATO15228 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNPATO15228 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNPATO15228 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNPATO15228 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNPATO15228 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNPATO15228 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GNPATO15228 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNPATO15228 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNPATO15228 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNPATO15228 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNPATO15228 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNPATO15228 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPATO15228 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPATO15228 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms