Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms