Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms