Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms