Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms