Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms