Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms