Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L4A6NEF3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms