Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms