Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms