Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IRGMA1A4Y4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms