Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-27A0A075B6S5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-27A0A075B6S5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms