Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itgb6Q9Z0T9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb6Q9Z0T9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb6Q9Z0T9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb6Q9Z0T9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb6Q9Z0T9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb6Q9Z0T9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb6Q9Z0T9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb6Q9Z0T9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb6Q9Z0T9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb6Q9Z0T9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb6Q9Z0T9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb6Q9Z0T9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb6Q9Z0T9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb6Q9Z0T9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb6Q9Z0T9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb6Q9Z0T9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb6Q9Z0T9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb6Q9Z0T9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb6Q9Z0T9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb6Q9Z0T9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb6Q9Z0T9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb6Q9Z0T9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb6Q9Z0T9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb6Q9Z0T9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb6Q9Z0T9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb6Q9Z0T9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb6Q9Z0T9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb6Q9Z0T9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb6Q9Z0T9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb6Q9Z0T9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb6Q9Z0T9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb6Q9Z0T9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb6Q9Z0T9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb6Q9Z0T9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb6Q9Z0T9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb6Q9Z0T9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb6Q9Z0T9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb6Q9Z0T9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb6Q9Z0T9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb6Q9Z0T9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb6Q9Z0T9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itgb6Q9Z0T9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb6Q9Z0T9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms