Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERGIC3Q9Y282 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERGIC3Q9Y282 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERGIC3Q9Y282 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERGIC3Q9Y282 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERGIC3Q9Y282 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERGIC3Q9Y282 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERGIC3Q9Y282 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC3Q9Y282 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERGIC3Q9Y282 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms