Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKM9

RALY, RNA-binding protein Raly, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALYQ9UKM9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RALYQ9UKM9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RALYQ9UKM9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RALYQ9UKM9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RALYQ9UKM9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RALYQ9UKM9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RALYQ9UKM9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RALYQ9UKM9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RALYQ9UKM9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RALYQ9UKM9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RALYQ9UKM9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALYQ9UKM9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALYQ9UKM9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALYQ9UKM9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RALYQ9UKM9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALYQ9UKM9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALYQ9UKM9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALYQ9UKM9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALYQ9UKM9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALYQ9UKM9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RALYQ9UKM9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALYQ9UKM9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALYQ9UKM9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RALYQ9UKM9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RALYQ9UKM9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RALYQ9UKM9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALYQ9UKM9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALYQ9UKM9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALYQ9UKM9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALYQ9UKM9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALYQ9UKM9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALYQ9UKM9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RALYQ9UKM9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RALYQ9UKM9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RALYQ9UKM9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RALYQ9UKM9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms