Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 SCML1-204ENST00000398080 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.683e-7■■■■■ 43.4
EXOSC5Q9NQT4 SCML1-202ENST00000380043 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.963e-7■■■■■ 43.4
EXOSC5Q9NQT4 SCML1-206ENST00000427362 846 ntTSL 56.87□□□□□ -1.313e-7■■■■■ 43.4
EXOSC5Q9NQT4 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 43.4
EXOSC5Q9NQT4 NFATC3-212ENST00000563288 3790 ntTSL 1 (best)5.73□□□□□ -1.492e-8■■■■■ 43.3
EXOSC5Q9NQT4 NFATC3-218ENST00000567152 3186 ntTSL 1 (best)5.08□□□□□ -1.62e-8■■■■■ 43.3
EXOSC5Q9NQT4 NFATC3-205ENST00000535127 4194 ntTSL 1 (best)4.81□□□□□ -1.642e-8■■■■■ 43.3
EXOSC5Q9NQT4 NFATC3-214ENST00000563796 3753 ntTSL 1 (best)4.1□□□□□ -1.752e-8■■■■■ 43.3
EXOSC5Q9NQT4 AC124312.1-202ENST00000557230 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 55.48□□□□□ -1.535e-7■■■■■ 43.2
EXOSC5Q9NQT4 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.585e-7■■■■■ 43.2
EXOSC5Q9NQT4 SNHG14-214ENST00000551361 550 ntTSL 34.04□□□□□ -1.765e-7■■■■■ 43.2
EXOSC5Q9NQT4 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.915e-7■■■■■ 43.2
EXOSC5Q9NQT4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 ASAP1-215ENST00000524299 550 ntTSL 48.44□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.491e-11■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.631e-11■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 ZNF790-AS1-202ENST00000587413 547 ntTSL 49.8□□□□□ -0.841e-11■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.245e-9■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.545e-9■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.655e-9■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.675e-9■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 FAM156A-222ENST00000622732 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 410.69□□□□□ -0.75e-9■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 FAM156A-220ENST00000622430 576 ntTSL 410.08□□□□□ -0.85e-9■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 FAM156A-202ENST00000610625 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 39.94□□□□□ -0.825e-9■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 FAM156A-204ENST00000612083 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 48.75□□□□□ -1.015e-9■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 FAM156A-219ENST00000622323 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 38.3□□□□□ -1.085e-9■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 FAM156A-211ENST00000616592 319 ntTSL 27.95□□□□□ -1.145e-9■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 FAM156A-217ENST00000619897 784 ntTSL 47.52□□□□□ -1.215e-9■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 FAM156A-209ENST00000615171 590 ntTSL 46.37□□□□□ -1.395e-9■■■■■ 43.1
EXOSC5Q9NQT4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.375e-7■■■■■ 43
EXOSC5Q9NQT4 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 513.45□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 43
EXOSC5Q9NQT4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.295e-7■■■■■ 43
EXOSC5Q9NQT4 ZNF782-202ENST00000430274 562 ntTSL 321.32■■□□□ 16e-8■■■■■ 43
EXOSC5Q9NQT4 ZNF782-207ENST00000498811 698 ntTSL 38.71□□□□□ -1.026e-8■■■■■ 43
EXOSC5Q9NQT4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.757e-7■■■■■ 42.7
EXOSC5Q9NQT4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.687e-7■■■■■ 42.7
EXOSC5Q9NQT4 C22orf39-204ENST00000509549 2979 ntTSL 210.5□□□□□ -0.736e-8■■■■■ 42.7
EXOSC5Q9NQT4 HIRA-204ENST00000464189 560 ntTSL 48.83□□□□□ -16e-8■■■■■ 42.7
EXOSC5Q9NQT4 HIRA-203ENST00000452818 453 ntTSL 58.83□□□□□ -16e-8■■■■■ 42.7
EXOSC5Q9NQT4 ZMYM2-205ENST00000382883 5445 ntTSL 54.34□□□□□ -1.711e-10■■■■■ 42.7
EXOSC5Q9NQT4 ZMYM2-201ENST00000382870 3456 ntTSL 1 (best)1.94□□□□□ -2.11e-10■■■■■ 42.7
EXOSC5Q9NQT4 ZNF782-204ENST00000478850 932 ntTSL 519.11■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 42.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 42.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF782-203ENST00000466833 628 ntTSL 39.6□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 42.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF782-201ENST00000289032 2355 ntTSL 26.04□□□□□ -1.441e-7■■■■■ 42.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.661e-7■■■■■ 42.6
EXOSC5Q9NQT4 TPTEP1-201ENST00000383140 971 ntTSL 1 (best)6.73□□□□□ -1.338e-8■■■■■ 42.5
EXOSC5Q9NQT4 OPCML-206ENST00000529038 1343 ntTSL 512.03□□□□□ -0.483e-11■■■■■ 42.5
EXOSC5Q9NQT4 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.173e-11■■■■■ 42.5
EXOSC5Q9NQT4 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.411e-10■■■■■ 42.1
EXOSC5Q9NQT4 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.491e-10■■■■■ 42.1
EXOSC5Q9NQT4 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.961e-10■■■■■ 42.1
EXOSC5Q9NQT4 NUTM2B-AS1-209ENST00000596088 366 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 42
EXOSC5Q9NQT4 NUTM2B-AS1-210ENST00000600376 510 ntTSL 33.89□□□□□ -1.794e-7■■■■■ 42
EXOSC5Q9NQT4 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.323e-9■■■■■ 42
EXOSC5Q9NQT4 FOXN3-206ENST00000554005 450 ntTSL 55.05□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 42
EXOSC5Q9NQT4 SCN4B-205ENST00000531550 1206 ntTSL 1 (best)14.71□□□□□ -0.054e-11■■■■■ 41.9
EXOSC5Q9NQT4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.394e-11■■■■■ 41.9
EXOSC5Q9NQT4 SCN4B-201ENST00000324727 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.714e-11■■■■■ 41.9
EXOSC5Q9NQT4 SCN4B-202ENST00000415030 4480 ntTSL 1 (best)10.37□□□□□ -0.754e-11■■■■■ 41.9
EXOSC5Q9NQT4 SCN4B-203ENST00000423160 3969 ntTSL 29.63□□□□□ -0.874e-11■■■■■ 41.9
EXOSC5Q9NQT4 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 41.8
EXOSC5Q9NQT4 AC016723.1-202ENST00000436982 643 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.283e-7■■■■■ 41.8
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 41.7
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 41.7
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 41.7
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-209ENST00000460591 898 ntTSL 37.11□□□□□ -1.273e-7■■■■■ 41.7
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-212ENST00000464596 989 ntTSL 56.78□□□□□ -1.323e-7■■■■■ 41.7
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.443e-7■■■■■ 41.7
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.443e-7■■■■■ 41.7
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.543e-7■■■■■ 41.7
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.573e-7■■■■■ 41.7
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.583e-7■■■■■ 41.7
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.753e-7■■■■■ 41.7
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.763e-7■■■■■ 41.7
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.793e-7■■■■■ 41.7
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.883e-7■■■■■ 41.7
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.923e-7■■■■■ 41.7
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.933e-7■■■■■ 41.7
EXOSC5Q9NQT4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 41.6
EXOSC5Q9NQT4 SMAD3-213ENST00000560175 542 ntTSL 410.47□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 41.6
EXOSC5Q9NQT4 SMAD3-211ENST00000559460 568 ntTSL 48.63□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 41.6
EXOSC5Q9NQT4 SMAD3-212ENST00000559937 579 ntTSL 47.14□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 41.6
EXOSC5Q9NQT4 AC026412.1-205ENST00000522848 1130 ntTSL 218.02■□□□□ 0.485e-7■■■■■ 41.6
EXOSC5Q9NQT4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 41.6
EXOSC5Q9NQT4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 41.6
EXOSC5Q9NQT4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 41.6
EXOSC5Q9NQT4 AC026412.1-204ENST00000507505 1009 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.355e-7■■■■■ 41.6
EXOSC5Q9NQT4 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC10.48□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 41.6
EXOSC5Q9NQT4 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.594e-47■■■■■ 41.5
EXOSC5Q9NQT4 MAN1B1-211ENST00000540391 3940 ntTSL 29.45□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 41.4
EXOSC5Q9NQT4 REV3L-205ENST00000422377 10964 ntTSL 213.02□□□□□ -0.335e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.625e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 REV3L-202ENST00000368802 10701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.855e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.255e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 REV3L-206ENST00000434009 10644 ntTSL 22.71□□□□□ -1.985e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.14e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 FOXP1-207ENST00000471386 299 ntTSL 1 (best)20.17■□□□□ 0.824e-6■■■■■ 41.3
Retrieved 100 of 8,799 protein–RNA pairs in 407.1 ms