Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hddc3Q9D114 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hddc3Q9D114 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hddc3Q9D114 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hddc3Q9D114 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hddc3Q9D114 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hddc3Q9D114 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hddc3Q9D114 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hddc3Q9D114 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hddc3Q9D114 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hddc3Q9D114 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hddc3Q9D114 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hddc3Q9D114 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hddc3Q9D114 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hddc3Q9D114 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hddc3Q9D114 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hddc3Q9D114 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hddc3Q9D114 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hddc3Q9D114 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hddc3Q9D114 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hddc3Q9D114 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hddc3Q9D114 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hddc3Q9D114 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hddc3Q9D114 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hddc3Q9D114 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hddc3Q9D114 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hddc3Q9D114 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hddc3Q9D114 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hddc3Q9D114 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hddc3Q9D114 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hddc3Q9D114 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hddc3Q9D114 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hddc3Q9D114 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hddc3Q9D114 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hddc3Q9D114 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hddc3Q9D114 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hddc3Q9D114 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hddc3Q9D114 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hddc3Q9D114 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hddc3Q9D114 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hddc3Q9D114 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hddc3Q9D114 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hddc3Q9D114 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hddc3Q9D114 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hddc3Q9D114 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hddc3Q9D114 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hddc3Q9D114 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hddc3Q9D114 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hddc3Q9D114 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hddc3Q9D114 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hddc3Q9D114 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hddc3Q9D114 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hddc3Q9D114 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hddc3Q9D114 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hddc3Q9D114 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hddc3Q9D114 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hddc3Q9D114 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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