Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Shisa9Q9CZN4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Shisa9Q9CZN4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Shisa9Q9CZN4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Shisa9Q9CZN4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Shisa9Q9CZN4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Shisa9Q9CZN4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Shisa9Q9CZN4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Shisa9Q9CZN4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisa9Q9CZN4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisa9Q9CZN4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms