Protein–RNA interactions for Protein: Q96RG2

PASK, PAS domain-containing serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASKQ96RG2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PASKQ96RG2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PASKQ96RG2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PASKQ96RG2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
PASKQ96RG2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PASKQ96RG2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PASKQ96RG2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PASKQ96RG2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PASKQ96RG2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PASKQ96RG2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PASKQ96RG2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PASKQ96RG2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PASKQ96RG2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PASKQ96RG2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
PASKQ96RG2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PASKQ96RG2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PASKQ96RG2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PASKQ96RG2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PASKQ96RG2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PASKQ96RG2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PASKQ96RG2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PASKQ96RG2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PASKQ96RG2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PASKQ96RG2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PASKQ96RG2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PASKQ96RG2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PASKQ96RG2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PASKQ96RG2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PASKQ96RG2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PASKQ96RG2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PASKQ96RG2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PASKQ96RG2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PASKQ96RG2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PASKQ96RG2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PASKQ96RG2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PASKQ96RG2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PASKQ96RG2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PASKQ96RG2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PASKQ96RG2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PASKQ96RG2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PASKQ96RG2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PASKQ96RG2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PASKQ96RG2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PASKQ96RG2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PASKQ96RG2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PASKQ96RG2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PASKQ96RG2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PASKQ96RG2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PASKQ96RG2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PASKQ96RG2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PASKQ96RG2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PASKQ96RG2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PASKQ96RG2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PASKQ96RG2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PASKQ96RG2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PASKQ96RG2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PASKQ96RG2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PASKQ96RG2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PASKQ96RG2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PASKQ96RG2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PASKQ96RG2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PASKQ96RG2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PASKQ96RG2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PASKQ96RG2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PASKQ96RG2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PASKQ96RG2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PASKQ96RG2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PASKQ96RG2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms