Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD3Q8N144 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD3Q8N144 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD3Q8N144 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD3Q8N144 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD3Q8N144 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD3Q8N144 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD3Q8N144 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD3Q8N144 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD3Q8N144 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD3Q8N144 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD3Q8N144 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD3Q8N144 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD3Q8N144 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD3Q8N144 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJD3Q8N144 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJD3Q8N144 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD3Q8N144 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD3Q8N144 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD3Q8N144 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD3Q8N144 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD3Q8N144 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJD3Q8N144 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJD3Q8N144 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD3Q8N144 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD3Q8N144 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD3Q8N144 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD3Q8N144 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD3Q8N144 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD3Q8N144 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJD3Q8N144 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD3Q8N144 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD3Q8N144 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD3Q8N144 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD3Q8N144 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD3Q8N144 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD3Q8N144 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD3Q8N144 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD3Q8N144 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJD3Q8N144 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD3Q8N144 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD3Q8N144 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD3Q8N144 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD3Q8N144 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GJD3Q8N144 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GJD3Q8N144 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms