Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT12Q8IV01 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT12Q8IV01 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT12Q8IV01 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT12Q8IV01 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT12Q8IV01 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT12Q8IV01 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT12Q8IV01 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT12Q8IV01 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT12Q8IV01 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT12Q8IV01 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT12Q8IV01 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT12Q8IV01 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT12Q8IV01 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT12Q8IV01 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT12Q8IV01 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT12Q8IV01 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT12Q8IV01 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT12Q8IV01 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT12Q8IV01 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT12Q8IV01 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYT12Q8IV01 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms