Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIF6

Sidt2, SID1 transmembrane family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sidt2Q8CIF6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sidt2Q8CIF6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sidt2Q8CIF6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sidt2Q8CIF6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sidt2Q8CIF6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sidt2Q8CIF6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sidt2Q8CIF6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sidt2Q8CIF6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sidt2Q8CIF6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sidt2Q8CIF6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sidt2Q8CIF6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sidt2Q8CIF6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sidt2Q8CIF6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sidt2Q8CIF6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sidt2Q8CIF6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sidt2Q8CIF6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sidt2Q8CIF6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sidt2Q8CIF6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sidt2Q8CIF6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sidt2Q8CIF6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sidt2Q8CIF6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sidt2Q8CIF6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sidt2Q8CIF6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sidt2Q8CIF6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sidt2Q8CIF6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sidt2Q8CIF6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sidt2Q8CIF6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sidt2Q8CIF6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sidt2Q8CIF6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sidt2Q8CIF6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sidt2Q8CIF6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sidt2Q8CIF6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sidt2Q8CIF6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sidt2Q8CIF6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sidt2Q8CIF6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sidt2Q8CIF6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sidt2Q8CIF6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sidt2Q8CIF6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sidt2Q8CIF6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sidt2Q8CIF6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sidt2Q8CIF6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sidt2Q8CIF6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sidt2Q8CIF6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sidt2Q8CIF6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sidt2Q8CIF6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sidt2Q8CIF6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sidt2Q8CIF6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sidt2Q8CIF6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sidt2Q8CIF6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sidt2Q8CIF6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sidt2Q8CIF6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sidt2Q8CIF6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sidt2Q8CIF6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sidt2Q8CIF6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sidt2Q8CIF6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sidt2Q8CIF6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sidt2Q8CIF6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sidt2Q8CIF6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sidt2Q8CIF6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sidt2Q8CIF6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sidt2Q8CIF6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sidt2Q8CIF6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sidt2Q8CIF6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sidt2Q8CIF6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sidt2Q8CIF6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sidt2Q8CIF6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sidt2Q8CIF6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sidt2Q8CIF6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sidt2Q8CIF6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sidt2Q8CIF6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sidt2Q8CIF6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sidt2Q8CIF6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sidt2Q8CIF6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sidt2Q8CIF6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sidt2Q8CIF6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sidt2Q8CIF6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sidt2Q8CIF6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms