Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gga3Q8BMI3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gga3Q8BMI3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Gga3Q8BMI3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gga3Q8BMI3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gga3Q8BMI3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gga3Q8BMI3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gga3Q8BMI3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gga3Q8BMI3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gga3Q8BMI3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gga3Q8BMI3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gga3Q8BMI3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Gga3Q8BMI3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gga3Q8BMI3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Gga3Q8BMI3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gga3Q8BMI3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gga3Q8BMI3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gga3Q8BMI3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gga3Q8BMI3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gga3Q8BMI3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gga3Q8BMI3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gga3Q8BMI3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gga3Q8BMI3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gga3Q8BMI3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gga3Q8BMI3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gga3Q8BMI3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gga3Q8BMI3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gga3Q8BMI3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gga3Q8BMI3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gga3Q8BMI3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gga3Q8BMI3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gga3Q8BMI3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gga3Q8BMI3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gga3Q8BMI3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gga3Q8BMI3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gga3Q8BMI3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gga3Q8BMI3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gga3Q8BMI3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gga3Q8BMI3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gga3Q8BMI3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gga3Q8BMI3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gga3Q8BMI3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gga3Q8BMI3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gga3Q8BMI3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gga3Q8BMI3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gga3Q8BMI3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gga3Q8BMI3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gga3Q8BMI3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gga3Q8BMI3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gga3Q8BMI3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gga3Q8BMI3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gga3Q8BMI3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gga3Q8BMI3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gga3Q8BMI3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gga3Q8BMI3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gga3Q8BMI3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Gga3Q8BMI3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gga3Q8BMI3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gga3Q8BMI3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gga3Q8BMI3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gga3Q8BMI3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gga3Q8BMI3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gga3Q8BMI3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gga3Q8BMI3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gga3Q8BMI3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gga3Q8BMI3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gga3Q8BMI3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gga3Q8BMI3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gga3Q8BMI3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gga3Q8BMI3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gga3Q8BMI3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gga3Q8BMI3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gga3Q8BMI3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gga3Q8BMI3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gga3Q8BMI3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Gga3Q8BMI3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gga3Q8BMI3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gga3Q8BMI3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gga3Q8BMI3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gga3Q8BMI3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gga3Q8BMI3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gga3Q8BMI3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gga3Q8BMI3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gga3Q8BMI3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gga3Q8BMI3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Gga3Q8BMI3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gga3Q8BMI3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gga3Q8BMI3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gga3Q8BMI3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gga3Q8BMI3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gga3Q8BMI3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gga3Q8BMI3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gga3Q8BMI3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gga3Q8BMI3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gga3Q8BMI3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms