Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H6

Frmd5, FERM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd5Q6P5H6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmd5Q6P5H6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmd5Q6P5H6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmd5Q6P5H6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmd5Q6P5H6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Frmd5Q6P5H6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Frmd5Q6P5H6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmd5Q6P5H6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmd5Q6P5H6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmd5Q6P5H6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmd5Q6P5H6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmd5Q6P5H6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmd5Q6P5H6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Frmd5Q6P5H6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmd5Q6P5H6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmd5Q6P5H6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmd5Q6P5H6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmd5Q6P5H6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmd5Q6P5H6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmd5Q6P5H6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmd5Q6P5H6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmd5Q6P5H6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmd5Q6P5H6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmd5Q6P5H6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmd5Q6P5H6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmd5Q6P5H6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmd5Q6P5H6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmd5Q6P5H6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmd5Q6P5H6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmd5Q6P5H6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmd5Q6P5H6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmd5Q6P5H6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmd5Q6P5H6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Frmd5Q6P5H6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmd5Q6P5H6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmd5Q6P5H6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmd5Q6P5H6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmd5Q6P5H6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmd5Q6P5H6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmd5Q6P5H6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmd5Q6P5H6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmd5Q6P5H6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmd5Q6P5H6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmd5Q6P5H6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmd5Q6P5H6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmd5Q6P5H6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms