Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CilpQ66K08 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CilpQ66K08 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CilpQ66K08 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CilpQ66K08 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CilpQ66K08 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CilpQ66K08 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CilpQ66K08 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CilpQ66K08 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CilpQ66K08 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CilpQ66K08 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CilpQ66K08 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CilpQ66K08 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CilpQ66K08 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CilpQ66K08 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CilpQ66K08 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CilpQ66K08 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CilpQ66K08 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CilpQ66K08 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CilpQ66K08 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CilpQ66K08 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CilpQ66K08 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CilpQ66K08 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CilpQ66K08 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CilpQ66K08 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CilpQ66K08 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CilpQ66K08 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CilpQ66K08 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CilpQ66K08 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CilpQ66K08 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CilpQ66K08 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CilpQ66K08 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CilpQ66K08 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CilpQ66K08 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CilpQ66K08 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CilpQ66K08 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CilpQ66K08 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CilpQ66K08 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CilpQ66K08 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CilpQ66K08 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CilpQ66K08 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CilpQ66K08 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CilpQ66K08 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CilpQ66K08 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CilpQ66K08 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CilpQ66K08 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CilpQ66K08 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CilpQ66K08 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CilpQ66K08 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CilpQ66K08 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CilpQ66K08 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CilpQ66K08 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CilpQ66K08 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CilpQ66K08 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CilpQ66K08 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CilpQ66K08 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CilpQ66K08 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CilpQ66K08 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CilpQ66K08 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms