Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUP188Q5SRE5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUP188Q5SRE5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NUP188Q5SRE5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NUP188Q5SRE5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NUP188Q5SRE5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NUP188Q5SRE5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NUP188Q5SRE5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NUP188Q5SRE5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
NUP188Q5SRE5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NUP188Q5SRE5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUP188Q5SRE5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUP188Q5SRE5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUP188Q5SRE5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUP188Q5SRE5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUP188Q5SRE5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUP188Q5SRE5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUP188Q5SRE5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NUP188Q5SRE5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NUP188Q5SRE5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
NUP188Q5SRE5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP188Q5SRE5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP188Q5SRE5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP188Q5SRE5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NUP188Q5SRE5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NUP188Q5SRE5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
NUP188Q5SRE5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUP188Q5SRE5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUP188Q5SRE5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUP188Q5SRE5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUP188Q5SRE5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUP188Q5SRE5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NUP188Q5SRE5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NUP188Q5SRE5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NUP188Q5SRE5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NUP188Q5SRE5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NUP188Q5SRE5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NUP188Q5SRE5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NUP188Q5SRE5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUP188Q5SRE5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUP188Q5SRE5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NUP188Q5SRE5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NUP188Q5SRE5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NUP188Q5SRE5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NUP188Q5SRE5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NUP188Q5SRE5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP188Q5SRE5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP188Q5SRE5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP188Q5SRE5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP188Q5SRE5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP188Q5SRE5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP188Q5SRE5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP188Q5SRE5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUP188Q5SRE5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP188Q5SRE5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NUP188Q5SRE5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NUP188Q5SRE5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NUP188Q5SRE5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34■■■■□ 3.03
NUP188Q5SRE5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP188Q5SRE5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP188Q5SRE5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP188Q5SRE5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP188Q5SRE5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUP188Q5SRE5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP188Q5SRE5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP188Q5SRE5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP188Q5SRE5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP188Q5SRE5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NUP188Q5SRE5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NUP188Q5SRE5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NUP188Q5SRE5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NUP188Q5SRE5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NUP188Q5SRE5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NUP188Q5SRE5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP188Q5SRE5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP188Q5SRE5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP188Q5SRE5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP188Q5SRE5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP188Q5SRE5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP188Q5SRE5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NUP188Q5SRE5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NUP188Q5SRE5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NUP188Q5SRE5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NUP188Q5SRE5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms