Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdgfl2Q3UMU9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdgfl2Q3UMU9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdgfl2Q3UMU9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms