Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q1T7F1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q1T7F1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q1T7F1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Q1T7F1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Q1T7F1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Q1T7F1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Q1T7F1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Q1T7F1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Q1T7F1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Q1T7F1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Q1T7F1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q1T7F1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q1T7F1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q1T7F1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Q1T7F1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q1T7F1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q1T7F1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q1T7F1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q1T7F1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Q1T7F1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q1T7F1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q1T7F1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q1T7F1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Q1T7F1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q1T7F1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q1T7F1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q1T7F1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q1T7F1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q1T7F1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q1T7F1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q1T7F1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q1T7F1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q1T7F1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q1T7F1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q1T7F1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q1T7F1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q1T7F1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q1T7F1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q1T7F1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q1T7F1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q1T7F1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q1T7F1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q1T7F1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q1T7F1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q1T7F1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q1T7F1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q1T7F1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q1T7F1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q1T7F1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q1T7F1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q1T7F1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q1T7F1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q1T7F1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q1T7F1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q1T7F1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q1T7F1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q1T7F1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q1T7F1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q1T7F1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q1T7F1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q1T7F1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q1T7F1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q1T7F1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q1T7F1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q1T7F1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q1T7F1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q1T7F1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q1T7F1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q1T7F1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q1T7F1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q1T7F1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q1T7F1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q1T7F1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q1T7F1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q1T7F1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q1T7F1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q1T7F1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q1T7F1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q1T7F1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q1T7F1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q1T7F1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q1T7F1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q1T7F1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q1T7F1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q1T7F1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q1T7F1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q1T7F1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q1T7F1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q1T7F1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q1T7F1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q1T7F1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q1T7F1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q1T7F1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q1T7F1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q1T7F1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q1T7F1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q1T7F1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q1T7F1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q1T7F1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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