Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PTPRKQ15262 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PTPRKQ15262 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PTPRKQ15262 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PTPRKQ15262 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PTPRKQ15262 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PTPRKQ15262 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
PTPRKQ15262 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PTPRKQ15262 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PTPRKQ15262 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PTPRKQ15262 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PTPRKQ15262 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PTPRKQ15262 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PTPRKQ15262 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PTPRKQ15262 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PTPRKQ15262 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
PTPRKQ15262 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PTPRKQ15262 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PTPRKQ15262 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PTPRKQ15262 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PTPRKQ15262 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PTPRKQ15262 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PTPRKQ15262 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PTPRKQ15262 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PTPRKQ15262 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PTPRKQ15262 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PTPRKQ15262 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PTPRKQ15262 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PTPRKQ15262 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PTPRKQ15262 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PTPRKQ15262 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PTPRKQ15262 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PTPRKQ15262 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
PTPRKQ15262 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
PTPRKQ15262 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PTPRKQ15262 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PTPRKQ15262 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PTPRKQ15262 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
PTPRKQ15262 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
PTPRKQ15262 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PTPRKQ15262 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PTPRKQ15262 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PTPRKQ15262 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PTPRKQ15262 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PTPRKQ15262 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PTPRKQ15262 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PTPRKQ15262 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PTPRKQ15262 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PTPRKQ15262 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PTPRKQ15262 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PTPRKQ15262 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PTPRKQ15262 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PTPRKQ15262 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PTPRKQ15262 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PTPRKQ15262 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PTPRKQ15262 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PTPRKQ15262 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
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